Im Justizministerium ist er wohl der umstrittenste Beamte: An Sektionschef Christian Pilnacek ist in den vergangenen Jahren von blauer, roter, grüner und pinker Seite Kritik geäußert worden. Etwa wegen umstrittener Weisungen oder des Empfangs von Beschuldigten in der Casinos-Affäre. Gleichzeitig gilt er als exzellenter Jurist und auch Legistiker, der in der Strafprozesssreform (StPO) große Meriten gesammelt hat.